Jaguary jak wszystkie koty posiada zdolność do świetnego widzenia w nocy. Źrenice jego oczu rozszerzają się do tego stopnia iż wypełniają niemal całe oko, a warstwa odblaskowa za siatkóka umożliwia komórkom lepsze wykorzystanie docierającego światła.
Z tych powodów jaguary są zwierzętami aktywnymi w nocy, i tak jak wiele zwierząt w swoim gatunku jest on samotnikiem i podróżuje w pojedynkę po swoim terenie łowieckim.
Dzień spędza na odpoczywaniu i wylegiwaniu się w jaskiniach lub innych podobnych zacisznych miejscach. Każdy jaguar ma swoje terytorium działania, którego wielkość zależy od dostępności pokarmu. Zwykle terytorium samic wynosi do 38 km2, co daje około 76 km2 w przypadku samców. Granica terytorium samców nakłada się na terytoria samic, a obie płci moczem oraz drapaniem kory wybranych drzew oznaczają swoje terytoria.